現在、母とは同じ敷地内ですが別棟(家が2軒建っており、別々に住んでいます)に住んでいるため、 近所の人(違う組の方)から、「うちも同じ敷地に2軒だが町会費は2軒分払っている。不公平ではないか。」 と言われたことがあります。

恐らくそのお宅は、世帯が別なのではないかと思われます。

また、前の自治会長(区長)さんからも「町会費は今は１軒分だけれどもそのうち2軒分もらうことになるかもしれない」と 言われたことがありますので、実際に世帯分離をしてしまうと2軒分を認めてしまうことになるのではないかと恐れています。

世帯分離した際には、役所から自治会長(区長)さんに世帯分離した情報が行くような気がします

自治会長さんに情報が行かないのであれば、すぐにでも世帯分離するのですが

【回答事例】

ここ言う「世帯分離」というのは、住民票上の手続き、あくまでも役所の事務処理上の話です

役所に対する手続きをどう行っているかは非常にデリケートな問題です

他言する必要はありませんし、詮索されるものでもありません
世帯分離することと町会に関することとは別のものと考えるべきだと思います

町会費に関するルールがどうなっているかによりますが、建物に関する規定はないのではないでしょうか

大きな「二世帯住宅」は１世帯分でよくて、別棟だったら２世帯分という決まりにはなっていないと思います

親から子への「代替わり」とするか、子世帯の独立とするか、本人の意思の問題だと思います

自治会長に、住民情報を閲覧する資格は与えられていないと思います

住民情報には使用目的が決められていますので、これを超えて利用することは違反行為となります